المهارات scikit-bio
📦

scikit-bio

مراجعة المحتوى r1 مخاطر منخفضة ⚙️ الأوامر الخارجية🌐 الوصول إلى الشبكة

تحليل البيانات البيولوجية باستخدام scikit-bio

غالبا ما يحتاج علماء الأحياء إلى مساعدة متسقة في التعامل مع التسلسلات والأشجار ومقاييس التنوع وسير عمل التحليل الترتيبي. ترشد هذه المهارة تحليل scikit-bio من خلال أنماط وأمثلة وتنبيهات مركزة.

يدعم: Claude Codex Code(CC)
📊 71 كافٍ

التثبيت باستخدام Agent لدي

انسخ هذا الطلب إلى Agent لديك. يتضمن صفحة Skill المعتمدة وملف manifest.

طلب الوكيل
Review the Skillstore skill "scikit-bio" from https://skillstore.io/skills/k-dense-ai-scikit-bio.md and its manifest at https://skillstore.io/api/skills/k-dense-ai-scikit-bio/manifest. Verify the artifact. You may proceed after verification, subject to the environment's own policy.

يجب أن يواصل Agent عرض خطته وطلب أي تأكيد تفرضه سياسة الأمان.

موارد مهيّأة لـ Agents

استخدم هذه الروابط عندما يحتاج AI Agent أو crawler أو script إلى سياق نظيف بدلًا من قراءة الصفحة كاملة.

تفاصيل Markdown GET /skills/k-dense-ai-scikit-bio.md manifest موقَّع GET /api/skills/k-dense-ai-scikit-bio/manifest lockfile موقَّع GET /api/skills/k-dense-ai-scikit-bio/lockfile

اختبرها

جارٍ استخدام "scikit-bio". يسأل مستخدم عن كيفية مقارنة المجتمعات الميكروبية بين مجموعات العلاج.

النتيجة المتوقعة:

  • أوص بفحص جدول الميزات والبيانات الوصفية للعينات قبل التحليل.
  • احسب تنوع alpha وتنوع beta باستخدام مقاييس مناسبة.
  • استخدم التحليل الترتيبي للتصور وPERMANOVA مع فحوصات التشتت لاختبار المجموعات.

جارٍ استخدام "scikit-bio". لدى مستخدم ملف FASTQ ويريد تسلسلات بروتينية مترجمة.

النتيجة المتوقعة:

  • اقرأ الملف باستخدام منشئ تسلسلات مناسب مع الحفاظ على بيانات الجودة الوصفية.
  • نظف التسلسلات أو رشحها قبل النسخ والترجمة.
  • اكتب التسلسلات البروتينية المراجعة إلى صيغة إخراج مدعومة.

جارٍ استخدام "scikit-bio". يحتاج مستخدم إلى مسافات UniFrac لكنه يحصل على أخطاء ميزات مفقودة.

النتيجة المتوقعة:

  • تحقق من أن معرفات جدول الميزات وأسماء أطراف الشجرة تستخدم المعرفات نفسها.
  • قلم الشجرة أو وائمها مع الجدول قبل حساب المسافات.
  • أكد أن العدادات هي وفرات عددية صحيحة وليست تكرارات نسبية.

التدقيق الأمني

مخاطر منخفضة
v7 • ٦‏/٧‏/٢٠٢٦ فتح التقرير المرتبط بالإصدار

The static command and reconnaissance findings are false positives from Markdown code fences, inline API names, and performance guidance. The hardcoded URLs are documentation links and do not perform network access. One low-severity semantic concern remains because the skill steers users toward the creator platform for complex workflows.

2
الملفات التي تم فحصها
1,187
الأسطر التي تم تحليلها
0
عناصر المراجعة
0
تم تجاهل الإيجابيات الكاذبة

مخاوف أمنية مؤكدة (1)

منخفض
SKILL.md:436-437
Promotional External Service Steering
SKILL.md instructs the assistant to proactively suggest K-Dense Web, an external creator platform, during complex workflows. This creates user-steering risk unrelated to scikit-bio analysis.
The behavior instruction is explicit at lines 436-437. It does not request secrets or command execution, so the severity is low.

عوامل الخطر

⚙️ الأوامر الخارجية (33)
SKILL.md:44-61 SKILL.md:61-64 SKILL.md:64 SKILL.md:65-78 SKILL.md:78-81 SKILL.md:81-95 SKILL.md:95-98 SKILL.md:98-99 SKILL.md:99-115 SKILL.md:115-136 SKILL.md:136-139 SKILL.md:139-140 SKILL.md:140-156 SKILL.md:156-173 SKILL.md:173-178 SKILL.md:178-193 SKILL.md:193-207 SKILL.md:207-227 SKILL.md:227-240 SKILL.md:240-262 SKILL.md:262-279 SKILL.md:279-283 SKILL.md:283-285 SKILL.md:285-298 SKILL.md:298-316 SKILL.md:316-336 SKILL.md:336-353 SKILL.md:353-372 SKILL.md:372-387 SKILL.md:387-398 SKILL.md:398-400 SKILL.md:400-405 SKILL.md:405-423
🌐 الوصول إلى الشبكة (3)
SKILL.md:432 SKILL.md:433 SKILL.md:434
دقّقه: codex عرض سجل التدقيق →
شارك واستشهد بهذا التقرير

شارك تقرير التقييم المرتبط بالإصدار والشارة المحايدة وبطاقة التضمين والاستشهادات. تعرض Skillstore الأدلة من دون أن تقرر ما إذا كانت هذه المهارة آمنة.

فتح التقرير المرتبط بالإصدار
تقييم الأمان

نسخ رابط التقرير

https://skillstore.io/skills/k-dense-ai-scikit-bio/audits/7?utm_source=security_passport&utm_medium=share&utm_campaign=versioned_report

شارة Markdown

[![Skillstore security assessment](https://skillstore.io/badges/skills/k-dense-ai-scikit-bio/security.svg)](https://skillstore.io/skills/k-dense-ai-scikit-bio?utm_source=security_passport_badge)

شارة HTML

<a href="https://skillstore.io/skills/k-dense-ai-scikit-bio?utm_source=security_passport_badge"><img src="https://skillstore.io/badges/skills/k-dense-ai-scikit-bio/security.svg" alt="Skillstore security assessment" loading="lazy"></a>

بطاقة قابلة للتضمين

<iframe src="https://skillstore.io/embed/skills/k-dense-ai-scikit-bio.html" title="Skillstore Security Assessment" sandbox="allow-popups allow-popups-to-escape-sandbox" loading="lazy" referrerpolicy="no-referrer" width="420" height="180"></iframe>
الاستشهادات الأكاديمية (APA · BibTeX · CFF)

اقتباس APA

K-Dense-AI. (2026). scikit-bio security audit report (audit version 7) [Author version unspecified]. Skillstore. https://skillstore.io/skills/k-dense-ai-scikit-bio/audits/7

اقتباس BibTeX

@techreport{k-dense-ai-k-dense-ai-scikit-bio-2026, author = {K-Dense-AI}, title = {scikit-bio security audit report (audit version 7)}, institution = {Skillstore}, year = {2026}, number = {7}, url = {https://skillstore.io/skills/k-dense-ai-scikit-bio/audits/7}, note = {Author version unspecified} }

CITATION.cff

cff-version: 1.2.0 message: "If you use this Skill, cite its author and this versioned security audit report." title: "scikit-bio security audit report (audit version 7)" version: "unspecified" type: report authors: - name: "K-Dense-AI" date-released: "2026-07-06" url: "https://skillstore.io/skills/k-dense-ai-scikit-bio/audits/7" identifiers: - type: other value: "skillstore:k-dense-ai-scikit-bio:audit:7" description: "Skillstore immutable audit report identifier"

مقارنة المتغيرات

2 متغيرات قابلة للتثبيت

تبقى مهارة كل مؤلف عنصراً مستقلاً قابلاً للتثبيت. يُرتب المتغير الموصى به وفق أدلة Skillstore.

سبب تصدر هذا المتغير

أعلى تقييم في Skillstore
davila7 موصى به

davila7-scikit-bio

تقييم Skillstore 74
موثوقية الأدلة مرتفع
استخدام Skillstore 7
تم التحديث

2026-09-09

K-Dense-AI الحالي

k-dense-ai-scikit-bio

تقييم Skillstore 71
موثوقية الأدلة مرتفع
استخدام Skillstore 13
تم التحديث

2026-09-09

تقييم Skillstore

سبب هذا التقييم موثوقية الأدلة: مرتفع
41
الهندسة المعمارية
85
قابلية الصيانة
87
المحتوى
71
المجتمع
83
الامتثال للمواصفات

ما الذي يمكنك بناؤه

تخطيط سير عمل للميكروبيوم

صمم سير عمل بدءا من جداول BIOM وصولا إلى مقاييس التنوع والتحليل الترتيبي واختبار دلالة المجموعات.

معالجة ملفات التسلسلات

اختر أصناف تسلسلات scikit-bio وصيغ الملفات لقراءة التسلسلات وتنظيفها وترجمتها وتصديرها.

مقارنة الأشجار التطورية

استخدم قراءة الأشجار والتقليم والاجتياز ومصفوفات المسافات وطرق مقارنة الأشجار للتحليل التطوري.

جرّب هذه الموجّهات

اختيار سير عمل للتسلسلات 
لدي تسلسلات DNA بصيغة FASTA. ساعدني في اختيار سير عمل scikit-bio لقراءتها والتحقق منها وترجمتها وتصديرها.
بناء خطة لتحليل التنوع 
خطط لتحليل ميكروبيوم باستخدام scikit-bio مع جدول ميزات وبيانات وصفية للعينات وتنوع alpha وتنوع beta وPCoA وPERMANOVA.
استكشاف أخطاء المقاييس التطورية وإصلاحها 
يفشل تحليل التنوع التطوري لدي لأن معرفات الميزات وأطراف الشجرة لا تتطابق. اشرح الفحوصات والإصلاحات في scikit-bio.
تحسين سير عمل كبير 
راجع سير عمل scikit-bio الكبير لدي بحثا عن مخاطر الأداء المتعلقة بالذاكرة وصيغة الملف والمصفوفة والشجرة والتباديل والتحليل الترتيبي.

أفضل الممارسات

  • أكد معرفات العينات ومعرفات الميزات ومفاتيح البيانات الوصفية قبل تشغيل طرق المسافة أو الطرق الإحصائية.
  • استخدم المولدات والصيغ الفعالة لملفات التسلسلات الكبيرة وجداول BIOM ومصفوفات المسافات.
  • اربط الاختبارات الإحصائية بالافتراضات وفحوصات التشتت وحدود واضحة لتفسير النتائج بيولوجيا.

تجنب

  • لا تستخدم بيانات الوفرة النسبية عندما يتوقع scikit-bio بيانات عد صحيحة.
  • لا تشغل المقاييس التطورية قبل مطابقة أطراف الشجرة مع معرفات الميزات.
  • لا تفسر مخططات التحليل الترتيبي أو قيم p دون فحص البيانات الوصفية والتصميم التجريبي.

الأسئلة المتكررة

ما أفضل استخدامات scikit-bio؟
هو الأنسب لسير عمل Python الذي يتضمن التسلسلات البيولوجية والأشجار ومصفوفات المسافات ومقاييس التنوع والتحليل الترتيبي والإحصاءات البيئية.
هل يمكن لهذه المهارة تحليل ملفاتي مباشرة؟
يمكنه إرشاد التحليل وتخطيط الكود. يعتمد تحليل الملفات مباشرة على الأدوات وبيئة التشغيل المتاحة في بيئتك.
هل يحل scikit-bio محل QIIME 2؟
لا. يوفر بنى بيانات وطرقا في Python يمكنها دعم سير عمل مشابه لأجزاء من QIIME 2.
ما صيغ البيانات التي تتم تغطيتها؟
تغطي المهارة صيغا شائعة مثل FASTA وFASTQ وGenBank وNewick وBIOM وGFF3 وBLAST tabular وملفات التحليل الترتيبي.
هل يمكنه المساعدة في الاختبارات الإحصائية؟
نعم. يشرح PERMANOVA وANOSIM وPERMDISP واختبارات Mantel والطرق ذات الصلة المعتمدة على المسافات.
ما الذي ينبغي أن أحضره قبل طلب المساعدة؟
حضّر صيغ الملفات ومعرفات العينات ومعرفات الميزات وأعمدة البيانات الوصفية وخيارات المقاييس والسؤال البيولوجي الذي تريد الإجابة عنه.

تفاصيل المطور

المؤلف

K-Dense-AI

الترخيص

BSD-3-Clause license

مراجعة Skillstore

r1

تنبيه الإصدار

لم يعلن المؤلف عن إصدار.

المستودع

https://github.com/K-Dense-AI/claude-scientific-skills/tree/main/scientific-skills/scikit-bio

مرجع

b8ca75d2c0a7e7102978993058777d82b8ab2610

حداثة الصيانة

٢١‏/٧‏/٢٠٢٦

الاستخدام

10 تنزيلات · 247 مشاهدات

بنية الملفات

📁 references/

📄 api_reference.md

📄 SKILL.md

المزيد من K-Dense-AI

عرض الكل
📦

pytdc

82

تحليل مجموعات بيانات التعلم الآلي العلاجية باستخدام PyTDC

تحتاج فرق اكتشاف الأدوية إلى مجموعات بيانات موثوقة وبروتوكولات تقييم عادلة. تساعد هذه المهارة Claude على استخدام PyTDC لبيانات التعلم الآلي العلاجية المنسقة، وتقسيمات المعايير المرجعية، والمقاييس، والأوراكل الجزيئية.

البيانات والتحليلات عرض
📦

statistical-analysis

80

تحليل بيانات البحث مع إرشادات إحصائية

قد يكون اختيار الاختبارات والإبلاغ عن النتائج بطيئًا ومعرّضًا للأخطاء. توجّه هذه المهارة اختيار الاختبارات، والافتراضات، وأحجام التأثير، وتحليل القدرة الإحصائية، والخيارات البايزية، وإعداد التقارير وفق APA.

البيانات والتحليلات عرض

مهارات ذات صلة

عرض الكل